Таблица 2.
Процент положительных значений “единиц отклонения”1 для разных наборов аминокислотных пар
Позиция 2 |
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
6 |
7 |
8 |
9 |
||||
Все пары |
46 |
45 |
44 |
45 |
47 |
46 |
45 |
45 |
49 |
||||
А-А-код 3 |
42 |
54 |
31 |
58 |
63 |
65 |
31 |
52 |
56 |
||||
П-К-код 4 |
47 |
50 |
51 |
57 |
49 |
49 |
49 |
51 |
52 |
||||
Р-Б-код 5 |
48 |
56 |
33 |
41 |
56 |
59 |
26 |
59 |
67 |
||||
Г-К-код 6 |
49 |
67 |
40 |
33 |
58 |
73 |
27 |
49 |
59 |
||||
К-К code7 |
50 |
57 |
36 |
44 |
59 |
64 |
29 |
49 |
54 |
||||
Гидрофобные пары 8 |
35 |
31 |
57 |
53 |
35 |
33 |
67 |
47 |
47 |
||||
Полярные пары 9 |
63 |
45 |
57 |
49 |
45 |
55 |
55 |
43 |
65 |
||||
Ионные пары 10 |
33 |
8 |
67 |
75 |
42 |
17 |
67 |
25 |
17 |
1
Единицы отклонения взяты из работы [45].2
Позиция второго аминокислотного остатка относительно первого остатка.3
А-А-код предложен Меклером [1], см. табл. 1.4
П-К-код предложен Меклером и Идлис [2], см. табл. 1.5
Код взаимодействия аминокислот, предложенный Рут-Бернштейном [7] , см. табл. 1.6
Код взаимодействия аминокислот, предложенный Фассиной и соавт. [16, 17], см. табл. 1.7
К-К-код предложен Чипенсом [12, 13], см. табл. 1.8
Пары, образованные Ala, Ile, Leu, Met, Phe, Pro, Val.9
Пары, образованные Asn, Gln, Cys, Ser, Thr, Trp, Tyr.10
Пары, образованные Asp или Glu с Arg, Lys или His.