Таблица 2. Процент положительных значений “единиц отклонения”1 для разных наборов аминокислотных пар

Позиция2

1

2

3

4

5

6

7

8

9

Все пары

46

45

44

45

47

46

45

45

49

А-А-код3

42

54

31

58

63

65

31

52

56

П-К-код4

47

50

51

57

49

49

49

51

52

Р-Б-код5

48

56

33

41

56

59

26

59

67

Г-К-код6

49

67

40

33

58

73

27

49

59

К-К code7

50

57

36

44

59

64

29

49

54

Гидрофобные пары8

35

31

57

53

35

33

67

47

47

Полярные пары9

63

45

57

49

45

55

55

43

65

Ионные пары10

33

8

67

75

42

17

67

25

17

1 Единицы отклонения взяты из работы [45].

2 Позиция второго аминокислотного остатка относительно первого остатка.

3 А-А-код предложен Меклером [1], см. табл. 1.

4 П-К-код предложен Меклером и Идлис [2], см. табл. 1.

5 Код взаимодействия аминокислот, предложенный Рут-Бернштейном [7] , см. табл. 1.

6 Код взаимодействия аминокислот, предложенный Фассиной и соавт. [16, 17], см. табл. 1.

7 К-К-код предложен Чипенсом [12, 13], см. табл. 1.

8 Пары, образованные Ala, Ile, Leu, Met, Phe, Pro, Val.

9 Пары, образованные Asn, Gln, Cys, Ser, Thr, Trp, Tyr.

10 Пары, образованные Asp или Glu с Arg, Lys или His.

Назад

Яндекс.Метрика
Hosted by uCoz