Таблица 1.
Различные варианта кода взаимодействия аминокислот
Пары аминокислот |
Код |
Значения “единиц отклонения” для положения 4 6 |
||||
А-A 1 |
П-К 2 |
Р-Б 3 |
К-К 4 |
Г-К 5 |
||
Ala–Ala |
|
+ |
|
|
|
8,4 |
Ala–Arg |
+ |
+ |
+ |
+ |
|
-1,3/-2,6 |
Ala–Cys |
+ |
+ |
|
+ |
|
1,2/0,2 |
Ala–Gly |
+ |
+ |
|
+ |
|
1,8/1,4 |
Ala–Pro |
|
+ |
|
|
+ |
-0,8/-1,5 |
Ala–Ser |
+ |
+ |
|
+ |
+ |
0,9/4,4 |
Ala–Thr |
|
+ |
|
|
+ |
-0,7/-0,1 |
Ala–Trp |
|
+ |
|
+ |
+ |
-2,2/0,5 |
Ala-Tyr |
|
|
|
|
+ |
-1,3/-0,6 |
Arg–Arg |
|
+ |
|
|
|
2,1 |
Arg–Cys |
|
+ |
|
|
|
-3,0/-1,7 |
Arg–Gly |
|
+ |
|
|
|
1,9/0,8 |
Arg–Ile |
|
|
|
|
+ |
-1,5/-2,9 |
Arg–Leu |
|
|
|
|
+ |
-2,1/-3,9 |
Arg–Pro |
+ |
+ |
|
+ |
|
0,2/1,9 |
Arg–Ser |
+ |
+ |
+ |
+ |
|
1,5/0,1 |
Arg–Thr |
+ |
+ |
|
+ |
|
0,1/-0,5 |
Arg–Trp |
|
+ |
|
|
|
-3,4/0,6 |
Arg–Val |
|
|
|
|
+ |
1,3/-1,8 |
Asn–Asn |
|
+ |
|
|
|
-0,9 |
Asn–Asp |
|
+ |
|
|
|
-2,6/-1,2 |
Asn–Cys |
|
|
|
|
+ |
1,6/0,4 |
Asn–His |
|
+ |
|
|
|
0,6/-0,5 |
Asn–Ile |
+ |
+ |
|
+ |
+ |
2,8/2,0 |
Asn–Leu |
|
|
+ |
+ |
+ |
2,4/-1,2 |
Asn–Met |
|
+ |
|
+ |
|
-1,5/0,5 |
Asn–Phe |
|
|
|
+ |
+ |
0,0/-2,5 |
Asn–Tyr |
|
+ |
|
|
|
1,3/1,2 |
Asn–Val |
+ |
+ |
|
+ |
+ |
-0,6/3,0 |
Asp–Asp |
|
+ |
|
|
|
-2,8 |
Asp–Cys |
|
|
|
|
+ |
-1,4/0,8 |
Asp–His |
|
+ |
|
|
|
0,0/-2,2 |
Asp–Ile |
+ |
+ |
|
+ |
+ |
1,1/-0,1 |
Asp–Leu |
|
|
+ |
+ |
+ |
-0,8/0,0 |
Asp–Met |
|
+ |
|
+ |
|
-2,3/-0,4 |
Asp–Phe |
|
|
|
+ |
+ |
1,9/0,9 |
Asp–Tyr |
|
+ |
|
|
|
5,9/-2,1 |
Asp–Val |
+ |
+ |
|
+ |
+ |
1,2/2,2 |
Cys–Cys |
|
+ |
|
|
|
0,3 |
Cys–Gln |
|
|
|
|
+ |
0,4/-1,1 |
Cys–Glu |
|
|
|
|
+ |
-1,2/-1,4 |
Cys–Gly |
|
+ |
|
|
|
4,1/1,0 |
Cys–His |
|
|
|
|
+ |
5,7/-0,9 |
Cys–Pro |
|
+ |
|
+ |
+ |
-3,1/-1,5 |
Cys–Ser |
|
+ |
|
+ |
|
0,3/0,0 |
Cys–Thr |
+ |
+ |
+ |
+ |
|
-1,3/-1,6 |
Cys–Trp |
|
+ |
|
|
|
-0,2/-0,2 |
Gln–Gln |
|
+ |
|
|
|
3,2 |
Gln–Glu |
|
+ |
|
|
|
4,6/1,4 |
Gln–Ile |
|
|
|
+ |
+ |
-0,4/-0,5 |
Gln–Leu |
+ |
+ |
|
+ |
+ |
0,1/-0,2 |
Gln–Lys |
|
+ |
|
|
|
0,1/1,1 |
Gln–Met |
|
|
|
+ |
|
-3,0/-1,2 |
Gln–Phe |
|
+ |
|
+ |
+ |
-0,8/-1,7 |
Gln–Val |
|
|
+ |
+ |
+ |
-0,4/-1,1 |
Glu–Glu |
|
+ |
|
|
|
1,5 |
Glu–Ile |
|
|
|
+ |
+ |
-3,2/-1,2 |
Glu–Leu |
+ |
+ |
+ |
+ |
+ |
3,6/-1,7 |
Glu–Lys |
|
+ |
|
|
|
6,2/4,4 |
Glu–Met |
|
|
|
+ |
|
-1,7/-0,4 |
Glu–Phe |
+ |
+ |
|
+ |
+ |
-1,3/-3,3 |
Glu–Val |
|
|
|
+ |
+ |
-0,7/-1,7 |
Gly–Gly |
|
+ |
|
|
+ |
-0,5 |
Gly–Pro |
+ |
+ |
+ |
+ |
|
0,4/0,9 |
Gly–Ser |
+ |
+ |
|
+ |
|
0,4/-0,3 |
Gly–Thr |
+ |
+ |
|
+ |
+ |
3,5/-1,8 |
Gly–Trp |
|
+ |
|
|
|
-0,1/1,4 |
His–His |
|
+ |
|
|
|
0,1 |
His–Ile |
|
+ |
|
+ |
|
1,0/1,9 |
His–Leu |
|
|
|
+ |
+ |
0,6/1,5 |
His–Met |
+ |
+ |
|
+ |
|
0,6/0,4 |
His–Phe |
|
|
|
+ |
+ |
-0,6/0,4 |
His–Tyr |
|
+ |
|
|
|
0,9/1,4 |
His–Val |
+ |
+ |
+ |
+ |
+ |
3,8/-0,8 |
Ile–Ile |
|
+ |
|
|
|
1,5 |
Ile–Lys |
|
|
|
+ |
+ |
-0,6/-0,7 |
Ile–Met |
|
+ |
|
|
|
0,1/2,5 |
Ile–Tyr |
+ |
+ |
+ |
+ |
|
0,0/-0,4 |
Ile–Val |
|
+ |
|
|
|
0,1/-1,9 |
Leu–Leu |
|
+ |
|
|
|
4,7 |
Leu–Lys |
+ |
+ |
|
+ |
+ |
-1,5/-1,4 |
Leu–Phe |
|
+ |
|
|
|
0,9/1,0 |
Leu–Tyr |
|
|
|
+ |
|
0,1/0,0 |
Lys–Lys |
|
+ |
|
|
|
0,0 |
Lys–Met |
|
|
|
+ |
|
-4,8/-1,4 |
Lys–Phe |
+ |
+ |
+ |
+ |
|
-1,5/0,6 |
Lys–Val |
|
|
|
+ |
+ |
-1,1/-1,9 |
Met–Met |
|
+ |
|
|
|
1,9 |
Met–Pro |
|
|
|
|
+ |
-0,5/-1,8 |
Met–Trp |
|
|
|
|
+ |
1,6/-1,2 |
Met–Tyr |
|
+ |
+ |
+ |
+ |
-1,0/2,2 |
Met–Val |
|
+ |
|
|
|
-0,1/1,2 |
Phe–Phe |
|
+ |
|
|
|
1,4 |
Phe–Tyr |
|
|
|
+ |
|
-0,6/0,2 |
Pro–Pro |
|
+ |
|
|
|
1,6 |
Pro–Ser |
|
+ |
|
+ |
|
1,5/-0,5 |
Pro–Thr |
|
+ |
|
|
|
1,5/0,6 |
Pro–Trp |
+ |
+ |
|
+ |
|
-1,4/-07 |
Ser–Ser |
|
+ |
+ |
+ |
|
5,4 |
Ser–Thr |
+ |
+ |
|
+ |
|
3,0/2,5 |
Ser–Trp |
|
+ |
|
+ |
|
2,2/-0,2 |
Thr–Thr |
|
+ |
|
|
|
0,7 |
Thr–Trp |
|
+ |
+ |
+ |
|
-0,8/0,9 |
Trp–Trp |
|
+ |
|
|
|
-0,3 |
Tyr–Tyr |
|
+ |
|
|
|
-1,5 |
Tyr–Val |
+ |
+ |
|
+ |
|
0,7/-1,8 |
Val–Val |
|
+ |
|
|
|
2,2 |
Всего |
26 |
79 |
14 |
55 |
41 |
|
1
А-A-код предложен Меклером [1].2
П-К-код предложен Меклером и Идлис [2].3
Код взаимодействия аминокислот, предложенный Рут-Бернштейном [7].4
К-К-код предложен Чипенсом [12, 13].5
Код взаимодействия аминокислот, предложенный Фассиной и соавт. [16, 17].6
По данным работы [45].