Таблица 3.
Средние значения “единиц отклонения”1 для разных наборов аминокислотных пар|
Позиция2 |
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
6 |
7 |
8 |
9 |
|
Все пары |
0,03 |
0,00 |
-0,03 |
0,00 |
-0,02 |
-0,03 |
0,00 |
-0,01 |
0,06 |
|
А-А-код 3 |
-0,23 |
0,84 |
-0,25 |
0,39 |
0,57 |
0,63 |
-0,33 |
0,22 |
0,20 |
|
П-К-код 4 |
0,01 |
0,34 |
0,31 |
0,48 |
0,02 |
0,14 |
0,36 |
0,18 |
0,09 |
|
Р-Б-код 5 |
0,31 |
1,02 |
-0,25 |
0,20 |
0,39 |
0,25 |
-0,62 |
0,37 |
0,47 |
|
Г-К-код 6 |
0,23 |
1,24 |
-0,16 |
-0,22 |
0,50 |
0,86 |
-0,59 |
0,24 |
0,46 |
|
К-К code 7 |
0,16 |
0,91 |
-0,30 |
-0,02 |
0,41 |
0,53 |
-0,45 |
0,16 |
0,22 |
|
Гидрофобные пары 8 |
-0,48 |
-0,89 |
0,44 |
0,32 |
-0,54 |
-0,40 |
0,55 |
0,08 |
0,19 |
|
Полярные пары 9 |
0,43 |
0,13 |
0,67 |
0,38 |
0,03 |
0,16 |
0,37 |
0,01 |
0,35 |
|
Ионные пары 10 |
-1,05 |
-2,04 |
1,82 |
2,30 |
-0,42 |
-0,93 |
0,64 |
-0,62 |
-0,67 |
1
Единицы отклонения взяты из работы [45].2
Позиция второго аминокислотного остатка относительно первого остатка.3
А-А-код предложен Меклером [1], см. табл. 1.4
П-К-код предложен Меклером и Идлис [2], см. табл. 1.5
Код взаимодействия аминокислот, предложенный Рут-Бернштейном [7] , см. табл. 1.6
Код взаимодействия аминокислот, предложенный Фассиной и соавт. [16, 17], см. табл. 1.7
К-К-код предложен Чипенсом [12, 13], см. табл. 1.8
Пары, образованные Ala, Ile, Leu, Met, Phe, Pro, Val.9
Пары, образованные Asn, Gln, Cys, Ser, Thr, Trp, Tyr.10
Пары, образованные Asp или Glu с Arg, Lys или His.