Таблица 1. Различные варианта кода взаимодействия аминокислот

Пары аминокислот

Код

Значения “единиц отклонения” для положения 46

А-A1

П-К2

Р-Б3

К-К4

Г-К5

Ala–Ala

 

+

 

 

 

8,4

Ala–Arg

+

+

+

+

 

-1,3/-2,6

Ala–Cys

+

+

 

+

 

1,2/0,2

Ala–Gly

+

+

 

+

 

1,8/1,4

Ala–Pro

 

+

 

 

+

-0,8/-1,5

Ala–Ser

+

+

 

+

+

0,9/4,4

Ala–Thr

 

+

 

 

+

-0,7/-0,1

Ala–Trp

 

+

 

+

+

-2,2/0,5

Ala-Tyr

 

 

 

 

+

-1,3/-0,6

Arg–Arg

 

+

 

 

 

2,1

Arg–Cys

 

+

 

 

 

-3,0/-1,7

Arg–Gly

 

+

 

 

 

1,9/0,8

Arg–Ile

 

 

 

 

+

-1,5/-2,9

Arg–Leu

 

 

 

 

+

-2,1/-3,9

Arg–Pro

+

+

 

+

 

0,2/1,9

Arg–Ser

+

+

+

+

 

1,5/0,1

Arg–Thr

+

+

 

+

 

0,1/-0,5

Arg–Trp

 

+

 

 

 

-3,4/0,6

Arg–Val

 

 

 

 

+

1,3/-1,8

Asn–Asn

 

+

 

 

 

-0,9

Asn–Asp

 

+

 

 

 

-2,6/-1,2

Asn–Cys

 

 

 

 

+

1,6/0,4

Asn–His

 

+

 

 

 

0,6/-0,5

Asn–Ile

+

+

 

+

+

2,8/2,0

Asn–Leu

 

 

+

+

+

2,4/-1,2

Asn–Met

 

+

 

+

 

-1,5/0,5

Asn–Phe

 

 

 

+

+

0,0/-2,5

Asn–Tyr

 

+

 

 

 

1,3/1,2

Asn–Val

+

+

 

+

+

-0,6/3,0

Asp–Asp

 

+

 

 

 

-2,8

Asp–Cys

 

 

 

 

+

-1,4/0,8

Asp–His

 

+

 

 

 

0,0/-2,2

Asp–Ile

+

+

 

+

+

1,1/-0,1

Asp–Leu

 

 

+

+

+

-0,8/0,0

Asp–Met

 

+

 

+

 

-2,3/-0,4

Asp–Phe

 

 

 

+

+

1,9/0,9

Asp–Tyr

 

+

 

 

 

5,9/-2,1

Asp–Val

+

+

 

+

+

1,2/2,2

Cys–Cys

 

+

 

 

 

0,3

Cys–Gln

 

 

 

 

+

0,4/-1,1

Cys–Glu

 

 

 

 

+

-1,2/-1,4

Cys–Gly

 

+

 

 

 

4,1/1,0

Cys–His

 

 

 

 

+

5,7/-0,9

Cys–Pro

 

+

 

+

+

-3,1/-1,5

Cys–Ser

 

+

 

+

 

0,3/0,0

Cys–Thr

+

+

+

+

 

-1,3/-1,6

Cys–Trp

 

+

 

 

 

-0,2/-0,2

Gln–Gln

 

+

 

 

 

3,2

Gln–Glu

 

+

 

 

 

4,6/1,4

Gln–Ile

 

 

 

+

+

-0,4/-0,5

Gln–Leu

+

+

 

+

+

0,1/-0,2

Gln–Lys

 

+

 

 

 

0,1/1,1

Gln–Met

 

 

 

+

 

-3,0/-1,2

Gln–Phe

 

+

 

+

+

-0,8/-1,7

Gln–Val

 

 

+

+

+

-0,4/-1,1

Glu–Glu

 

+

 

 

 

1,5

Glu–Ile

 

 

 

+

+

-3,2/-1,2

Glu–Leu

+

+

+

+

+

3,6/-1,7

Glu–Lys

 

+

 

 

 

6,2/4,4

Glu–Met

 

 

 

+

 

-1,7/-0,4

Glu–Phe

+

+

 

+

+

-1,3/-3,3

Glu–Val

 

 

 

+

+

-0,7/-1,7

Gly–Gly

 

+

 

 

+

-0,5

Gly–Pro

+

+

+

+

 

0,4/0,9

Gly–Ser

+

+

 

+

 

0,4/-0,3

Gly–Thr

+

+

 

+

+

3,5/-1,8

Gly–Trp

 

+

 

 

 

-0,1/1,4

His–His

 

+

 

 

 

0,1

His–Ile

 

+

 

+

 

1,0/1,9

His–Leu

 

 

 

+

+

0,6/1,5

His–Met

+

+

 

+

 

0,6/0,4

His–Phe

 

 

 

+

+

-0,6/0,4

His–Tyr

 

+

 

 

 

0,9/1,4

His–Val

+

+

+

+

+

3,8/-0,8

Ile–Ile

 

+

 

 

 

1,5

Ile–Lys

 

 

 

+

+

-0,6/-0,7

Ile–Met

 

+

 

 

 

0,1/2,5

Ile–Tyr

+

+

+

+

 

0,0/-0,4

Ile–Val

 

+

 

 

 

0,1/-1,9

Leu–Leu

 

+

 

 

 

4,7

Leu–Lys

+

+

 

+

+

-1,5/-1,4

Leu–Phe

 

+

 

 

 

0,9/1,0

Leu–Tyr

 

 

 

+

 

0,1/0,0

Lys–Lys

 

+

 

 

 

0,0

Lys–Met

 

 

 

+

 

-4,8/-1,4

Lys–Phe

+

+

+

+

 

-1,5/0,6

Lys–Val

 

 

 

+

+

-1,1/-1,9

Met–Met

 

+

 

 

 

1,9

Met–Pro

 

 

 

 

+

-0,5/-1,8

Met–Trp

 

 

 

 

+

1,6/-1,2

Met–Tyr

 

+

+

+

+

-1,0/2,2

Met–Val

 

+

 

 

 

-0,1/1,2

Phe–Phe

 

+

 

 

 

1,4

Phe–Tyr

 

 

 

+

 

-0,6/0,2

Pro–Pro

 

+

 

 

 

1,6

Pro–Ser

 

+

 

+

 

1,5/-0,5

Pro–Thr

 

+

 

 

 

1,5/0,6

Pro–Trp

+

+

 

+

 

-1,4/-07

Ser–Ser

 

+

+

+

 

5,4

Ser–Thr

+

+

 

+

 

3,0/2,5

Ser–Trp

 

+

 

+

 

2,2/-0,2

Thr–Thr

 

+

 

 

 

0,7

Thr–Trp

 

+

+

+

 

-0,8/0,9

Trp–Trp

 

+

 

 

 

-0,3

Tyr–Tyr

 

+

 

 

 

-1,5

Tyr–Val

+

+

 

+

 

0,7/-1,8

Val–Val

 

+

 

 

 

2,2

Всего

26

79

14

55

41

 

1 А-A-код предложен Меклером [1].

2 П-К-код предложен Меклером и Идлис [2].

3 Код взаимодействия аминокислот, предложенный Рут-Бернштейном [7].

4 К-К-код предложен Чипенсом [12, 13].

5 Код взаимодействия аминокислот, предложенный Фассиной и соавт. [16, 17].

6 По данным работы [45].

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