Меклер Л.Б., Идлис Р.Г.
Москва 1981
Таблица 2
Трасса, реализуемая при построении модели
трехмерной молекулы репрессора
cro
согласно А–А коду
|
1 |
мет |
|
5 |
2 |
глу |
|
|
3 |
глн |
|
46 |
4 |
арг |
|
45, 10 |
5 |
иле |
|
|
6 |
тре |
Два витка спирали с шагом 5, левая спираль |
2 |
7 |
лей |
2 |
(14?) |
8 |
лиз |
экв 3 |
|
9 |
асп |
ионная связь с 4 (?) |
5 |
10 |
тир |
5 |
15 |
11 |
ала |
экв 6 |
|
12 |
мет |
|
17, 6? |
13 |
арг |
6? |
18, (8?) |
14 |
фен |
8? |
43, (19), 6?, 11? |
15 |
гли |
11? 6? Два витка спирали с шагом 4, правая спираль |
42 |
16 |
глн |
|
13 |
17 |
тре |
|
23, 14 |
18 |
лиз |
14 Распад связи 14–8(?) |
24, (15) |
19 |
тре |
15 |
|
20 |
ала |
|
58, (41) |
21 |
лиз |
Один виток спирали с шагом 5 |
55, (40) |
22 |
асп |
|
27, 18 |
23 |
лей |
18 |
36, (28), 19 |
24 |
гли |
19 |
35 |
25 |
вал |
|
34, (30) |
26 |
тир |
экв 22 |
23 |
27 |
глн |
23 Полтора витка спирали с шагом 4 |
36, (24) |
28 |
сер |
24 |
|
29 |
ала |
|
(26) |
30 |
иле |
26 |
|
31 |
асп |
|
|
32 |
лиз |
Поворот цепи на 180º |
|
33 |
ала |
и возврат по принципу молнии |
26 |
34 |
иле |
26 Распад связи 26–30 |
25 |
35 |
гис |
45, 25 |
24, 28 |
36 |
ала |
24 или 28 Распад связи 24–28 |
|
37 |
гли |
Переход через виток спирали |
|
38 |
арг |
|
|
39 |
лиз |
|
(22) |
40 |
иле |
22 |
54, (21) |
41 |
фен |
21 |
53, 16 |
42 |
лей |
16 |
15 |
43 |
тре |
15 Распад связи 15–19 |
51 |
44 |
иле |
|
50, 5 |
45 |
асн |
5 |
49?, 4 |
46 |
ала |
4 |
|
47 |
асп |
Поворот цепи на 180º |
65 |
48 |
гли |
|
64, 46? |
49 |
сер |
46? |
45 |
50 |
вал |
45 |
44 |
51 |
тир |
44 |
60 |
52 |
ала |
экв 43 |
|
53 |
глу |
42 |
58, 41 |
54 |
глу |
41 Распад связи 41–21 |
22 |
55 |
вал |
22 Распад связи 40–22, экв. 40 |
|
56 |
лиз |
Поворот цепи на 180º |
|
57 |
про |
|
54, 21 |
58 |
фен |
54 или 21 |
|
59 |
про |
|
52 |
60 |
сер |
52 |
|
61 |
асн |
экв 51 |
|
62 |
лиз |
|
|
63 |
лиз |
|
49 |
64 |
тре |
49 |
48 |
65 |
тре |
48 |
|
66 |
ала |
|
При образовании комплекса с регуляторной областью ДНК – замыкания кольца – образуются А–А связи: гис-35–мет-1, иле-30–асп-47, ала-29–гли-48 (?).