Таблица 1
Доказательство справедливости А-А-кода и П-К-кода результатами статистического анализа встречаемости А-А-пар и П-К-пар аминокислотных остатков в b-структурах белков
|
№№ |
Объект анализа | Всего пар АО, стоящих в суперпозиции | А-А-пар (ожидание - 17%) | П-К-пар (ожидание - 36%) | Гидрофобных пар (ожидание - 17%)* | Полярных пар (ожидание - 35%)** | Ионных пар (ожидание - 2,5%)*** |
| 1. | Инсулин, димер: b-структура | 6 | 3 (50%) | 5 (83%) | 1 (17%) | 2 (33%) | 1 (17%) |
| 2. | Лицозим белка куриного яйца, b-структура | 12 | 6 (50%) | 9 (75%) | 0 (0%) | 9 (75%) | 0 |
| 3. | Панкреатический ингибитор трипсина крупного рогатого скота | 24 | 4 (17%) | 10 (42%) | 2 (8%) | 11 (46%) | 0 |
| 4. | Рибонуклеаза S крупного рогатого скота | 63 | 14 (22%) | 28 (44%) | 9 (14%) | 21 (33%) | 2 (3%) |
| 5. | Рубредоксин C. pasteurianum | 19 | 5 (26%) | 11 (58%) | 1 (5%) | 6 (32%) | 0 |
| 6. | Актиноксантин | 51 | 9 (18%) | 27 (53%) | 13 (25%) | 19 (37% | 0 |
| 7. | Иммуноглобулин: Fab-фрагмент Ig New человека | 243 | 56 (23%) | 114 (47%) | 42 (17%) | 92 (38%) | 2 (0,8%) |
| 8. | Протеаза А | 147 | 39 (27%) | 74 (50%) | 16 (11%) | 59 (41%) | 0 |
| 9. | g-химотрипсин | 181 | 34 (19%) | 81 (45%) | 36 (20%) | 46 (25%) | 0 |
|
Всего |
746 |
170 (23%) |
359 (48%) |
120 (16%) |
265 (36%) |
5 (0,7%) |
|
| хи-квадрат | 19 | 47 | 0,5 | 0,1 | 10,2 | ||
| Вероятность случайности | 10-5 | 10-12 | 0,5 | 0,75 | 10-3 | ||
Примечание.
* Гидрофобными считаем аминокислотные остатки: Phe, Leu, Ile, Met, Val, Pro, Ala и S-S-мостик Cys-Cys.
** Полярными считаем аминокислотные остатки: Gln, Asn, Gly, Cys, Ser, Thr, Tyr, Trp.
••• Ионными парами считаем такие пары стоящих в суперпозиции аминокислотных остатков, один из которых Asp или Glu, а другой - His, Lys или Аrg. Видим, что Природа избегает устанавливать в b-структурах белков ионные пары!
Титульный лист | Физико-химическая биология | Меклер
