Меклер Л.Б., Идлис Р.Г.

Построение моделей трехмерных молекул биологических полипептидов и нуклеопротеидов согласно общему коду, определяющему специфическое линейное узнавание и связывание аминокислотными остатками полипептидов как друг друга, так и тринуклеотидов полинуклеотидов

Москва 1981

Таблица 4

Трасса, реализуемая при построении модели трехмерной молекулы лизоцима белка куриного яйца согласно А–А коду

 

1

лиз

 

15?

2

вал

15*?

(7)

3

фен

 
 

4

гли

 

(9)

5

арг

 

(S–S) 127, (10)

6

цис

 

(3)

7

глу

3

 

8

лей

 

128, (5)

9

ала

5

127, 14, (6)

10

ала

6               Спираль с шагом 4; четыре витка

126

11

ала

 
 

12

мет

 

(17)

13

лиз

 

10

14

арг

10

2

15

гис

 

24

16

гли

 

(13)

17

лей

13

120

18

асп

 

29

19

асн

 
 

20

тир

 

31

21

арг

 

32

22

гли

 
 

23

тир

 

16

24

сер

16

35

25

лей

экв 17

122, 36

26

гли

 
 

27

асн

 
 

28

три

 

119, 39, 19

29

вал

19                

118, (S–S)115,40

30

цис

                            Спираль с шагом 10, 2,5 витка

21

31

ала

21

22

32

ала

22

 

33

лиз

 
 

34

фен

 

25

35

глу

25

110, 49, 26

36

сер

26

 

37

асн

экв 27

 

38

фен

 

29

39

асн

29

45, 30

40

тре

30

 

41

глн

 

52

42

ала

 
 

43

тре

 

58

44

асн

 

40

45

арг

40         Связь поперек витка

 

46

асн

 

61

47

тре

 

109

48

асп

 

107, 36

49

гли

36        Спираль с шагом 12, один виток

47

50

сер

47        Связь поперек витка

114 (76)

51

тре

 
 

52

асп

 

58

53

тир

 

42

54

гли

42

101

55

иле

 
 

56

лей

 
 

57

гли

 

44, 53

58

иле

44, 53 Связь поперек витка

98

59

асн

 

(73)

60

сер

 

(72), 47

61

арг

47

62

три

 

79, 70

63

три

 

(S–S) 80, 69

64

цис

 
 

65

асн

 
 

66

асп

 

85

67

гли

 

86

68

арг

 

64

69

тре

64                     Возврат цепи к NH2-концу

63

70

про

63

89

71

гли

экв 62

90, (61)

72

сер

61

91, (60)

73

арг

60

78, 92

74

асн

экв 59

 

75

лей

 

(S–S) 94, (51)

76

цис

51

 

77

асн

экв 59

74

78

иле

74                     Связь поперек витка. Распад связи 51–76

73, 63

79

про

63                     Связь поперек витка, затем 73

64 (S–S)

80

цис

64 (S–S)           Связь поперек витка

68

81

сер

68                     Связь поперек витка

 

82

ала

 
 

83

лей

 
 

84

лей

                                    Спираль с шагом 16–18, 2,5 витка

67

85

сер

67   Цепь идет      сверху, дальше по принципу молнии

104, 68

86

сер

68                         Распад связи 69–64

 

87

асп

 

106

88

иле

 

71

89

тре

71

72

90

ала

72                       Распад связи 72–61

73

91

сер

73                       Распад связи 73–60

74

92

вал

74                       Распад связи 74–78

 

93

асн

 

76 (S–S)

94

цис

76 76 (S–S)

 

95

ала

 
 

96

лиз

 
 

97

лиз

 

59

98

иле

59

 

99

вал

 

82

100

сер

82

55

101

асп

55

 

102

гли

экв 54

 

103

асп

экв 53

86

104

гли

86

 

105

мет

 

88

106

асн

88

 

107

ала

 
 

108

три

 

48

109

вал

48 Связь поперек витка

36

110

ала

36 Связь поперек витка, цепь поворачивает на 180°

 

111

три

 
 

112

арг

экв 49

 

113

асн

 

51

114

арг

51

30 (S–S), 40

115

цис

40, 30 (S–S)

 

116

лиз

 
 

117

гли

 

30

118

тре

30 Связь поперек витка

29

119

асп

29 Связь поперек витка

18

120

вал

18 Связь поперек витка

17

121

глн

17 Связь поперек витка. Распад связи 17–23

26

122

ала

26 Подъем цепи вверх

 

123

три

 
 

124

иле

 
 

125

арг

Цепь внедряется между ранее сформировавшимися

11

126

гли

11 цепями и движется далее по принципу молнии,

(S–S) 6, 10

127

цис

распад связи 6–10

9

128

арг

9

 

129

лей

экв 8

* Эта связь образуется после распада связи 3–7, в результате чего NH2-конец цепи получает возможность соскользнуть вниз по поверхности молекулы.

Оглавление

Титульный лист | Физико-химическая биология | Меклер

Яндекс.Метрика
Hosted by uCoz