Меклер Л.Б., Идлис Р.Г.

Построение моделей трехмерных молекул биологических полипептидов и нуклеопротеидов согласно общему коду, определяющему специфическое линейное узнавание и связывание аминокислотными остатками полипептидов как друг друга, так и тринуклеотидов полинуклеотидов

Москва 1981

Таблица 2

Трасса, реализуемая при построении модели трехмерной молекулы репрессора cro согласно А–А коду
 

 

1

мет

 

5

2

глу

 

 

3

глн

 

46

4

арг

 

45, 10

5

иле

 

 

6

тре

 Два витка спирали с шагом 5, левая спираль

2

7

лей

2

(14?)

8

лиз

экв 3

 

9

асп

ионная связь с 4 (?)

5

10

тир

5

15

11

ала

экв 6

 

12

мет

 

17, 6?

13

арг

6?

18, (8?)

14

фен

8?

43, (19), 6?, 11?

15

гли

 11? 6? Два витка спирали с шагом 4, правая спираль

42

16

глн

 

13

17

тре

 

23, 14

18

лиз

14        Распад связи 14–8(?)

24, (15)

19

тре

15

 

20

ала

 

58, (41)

21

лиз

Один виток спирали с шагом 5

55, (40)

22

асп

 

27, 18

23

лей

18

36, (28), 19

24

гли

19

35

25

вал

 

34, (30)

26

тир

экв 22

23

27

глн

23         Полтора витка спирали с шагом 4

36, (24)

28

сер

24

 

29

ала

 

(26)

30

иле

26

 

31

асп

 

 

32

лиз

Поворот цепи на 180º

 

33

ала

и возврат по принципу молнии

26

34

иле

26 Распад связи 26–30

25

35

гис

45, 25

24, 28

36

ала

24 или 28 Распад связи 24–28

 

37

гли

Переход через виток спирали

 

38

арг

 

 

39

лиз

 

(22)

40

иле

22

54, (21)

41

фен

21

53, 16

42

лей

16

15

43

тре

15 Распад связи 15–19

51

44

иле

 

50, 5

45

асн

5

49?, 4

46

ала

4

 

47

асп

Поворот цепи на 180º

65

48

гли

 

64, 46?

49

сер

46?

45

50

вал

45

44

51

тир

44

60

52

ала

экв 43

 

53

глу

42

58, 41

54

глу

41 Распад связи 41–21

22

55

вал

22 Распад связи 40–22, экв. 40

 

56

лиз

Поворот цепи на 180º

 

57

про

 

54, 21

58

фен

54 или 21

 

59

про

 

52

60

сер

52

 

61

асн

экв 51

 

62

лиз

 

 

63

лиз

 

49

64

тре

49

48

65

тре

48

 

66

ала

 

 

При образовании комплекса с регуляторной областью ДНК – замыкания кольца – образуются А–А связи: гис-35–мет-1, иле-30–асп-47, ала-29–гли-48 (?).

Оглавление

Титульный лист | Физико-химическая биология | Меклер

Яндекс.Метрика